Una vez la pareja ha decidido iniciar un tratamiento de alta tecnología se encuentra con otro tipo de decisión ha tomar. En consulta con su médico deben analizar lo relativo a la congelación (criopreservacion) y disposición de sus embriones.
La Criopreservacion de embriones ha venido a ser una de los más importantes desarrollos de las nuevas técnicas de reproducción, permitiendo a muchas parejas tener significativas ventajas sobre el ciclo de las Técnicas de Reproducción Asistida y extender sus posibilidades de reproducción.

Muchas mujeres producen más de los óvulos que pueden ser transferidos en un ciclo. Los óvulos extras pueden ser inseminados y si éstos son de buena calidad, pueden ser procesados para su criopreservación y ser usados en el futuro.

Los embriones son congelados de uno a tres días después de la inseminación en una solución crioprotectora y guardados en pajillas plásticas en tanques con nitrógeno liquido. Si la mujer no concibe en ese ciclo, la pareja puede utilizar los embriones congelados durante un ciclo natural. Para llevarlo a cabo la paciente es monitoreada cuidadosamente por exámenes de sangre y ultrasonidos; y cuando el útero de la mujer esta receptivo, los embriones son descongelados y transferidos.

El ciclo de transferencia de embriones descongelados es mucho más fácil y representa para la pareja un costo más bajo que un ciclo en donde el procedimiento consiste en estimular, aspirar óvulos y fertilizarlos. Para este ciclo no hay necesidad que la paciente tome medicamentos para estimularla, sino que por lo general sólo debe tomar medicamentos para conseguir una óptima condición del útero.

Adicionalmente, si la pareja logra concebir durante el ciclo del procedimiento y desean más niños en el futuro, ellos pueden volver a intentarlo sometiéndose a un ciclo de procedimiento con embriones descongelados, con la esperanza de lograr otro embarazo. No hay evidencia que los niños que nacen de embriones congelados tengan algún problema de nacimiento, defectos físicos o problemas intelectuales en comparación con otros niños.